سرانه سالانه دانشجویان دکتری تخصصی، الان سالی ۳۵ میلیون تومان است؛ اما سرانه تعیین‌شده از سمت سازمان برنامه‌وبودجه، سالی ۲۸۴ میلیون تومان تعیین شده و درواقع دانشجویان دکتری تخصصی تنها ۱۲ درصد از میزان هزینه دانشگاه را سالانه به دانشگاه می‌دهند.

دانشجویان دانشگاه آزاد در طول یک ترم تحصیلی، باید مبلغی را به عنوان شهریه پرداخت کنند. این مبلغ با توجه به رشته و سال ورودی متفاوت است.

رئیس دانشگاه آزاد اسلامی با تاکید بر اینکه«شهریه» در منابع درآمدی این دانشگاه نقش کلیدی ایفا نمی‌کند، گفت: تلاش سرمایه انسانی و تلاش دانشی منتج به نوآوری،به ایجاد بودجه دانشگاه منتهی می‌شود. در سال تحصیلی پیش رو، تورم در میزان افزایش شهریه لحاظ نخواهد شد و همان درصدی که پارسال در افزایش شهریه‌ها اعمال شد، امسال نیز همان درصد افزایش شهریه خواهیم داشت.